Музейная коллекция строматолитов весьма представительна и разнообразна, она насчитывает более 160 предметов, относящихся почти к 50 видам. Большинство коллекционных предметов – это отшлифованные пластины размером от 10 до 15 см и толщиной около одного сантиметра, хотя имеются и необработанные (не распиленные) образцы.

География сборов очень широка и охватывает большую часть Евразии. В коллекции имеются образцы из разных регионов нашей страны и соседних государств: с Кольского полуострова и из Крыма, с южного Урала и из Забайкалья, с берегов Енисея и из Саудовской Аравии, из Карелии и южного Казахстана, с полуострова Таймыр и из Гималаев. Возраст строматолитов также самый разный ― от более двух миллиардов лет до современности.

Основу музейного собрания составляют образцы из личной коллекции одного из крупнейших отечественных специалистов в этой области, доктора геолого-минералогических наук И.Н. Крылова. Он изучил геологические разрезы рифея и раннего палеозоя Южного Урала и Сибири, проследил закономерности направленных морфологических изменений водорослевых построек и внёс большой вклад в разработку систематики строматолитов. Также он впервые выделил и описал ряд новых родов и видов. Свою коллекцию он передал в дар музею в 1969 – 1972 гг.

Предметы из этой коллекции демонстрируются в основной экспозиции Биологического музея (залы «Растения, грибы и бактерии» и «Развитие жизни на Земле»), а также на выставке «12 признаков живого» в павильоне «Геология» на ВДНХ.